MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 1044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187107	TCA	2	6	33	38	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NT_187107	CAT	2	6	125	130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NT_187107	GTC	2	6	197	202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NT_187107	AT	3	6	235	240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187107	CTC	2	6	245	250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NT_187107	TTTC	2	8	395	402	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NT_187107	TGA	2	6	411	416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187107	TCT	2	6	429	434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NT_187107	CTTT	2	8	451	458	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NT_187107	CTTT	2	8	492	499	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NT_187107	TCT	2	6	546	551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NT_187107	A	6	6	616	621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187107	GGCG	2	8	688	695	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14	NT_187107	CATA	2	8	710	717	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NT_187107	AAG	2	6	745	750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187107	CG	3	6	786	791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NT_187107	TCA	2	6	801	806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NT_187107	AAC	2	6	885	890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NT_187107	GGCC	2	8	901	908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NT_187107	GAA	2	6	949	954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NT_187107	TCA	2	6	1014	1019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250981
22	NT_187107	GAC	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250981
23	NT_187107	ACGA	2	8	1072	1079	50 %	0 %	25 %	25 %	409250981
24	NT_187107	GAC	2	6	1093	1098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250981
25	NT_187107	ACC	2	6	1099	1104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250981
26	NT_187107	ACGTT	2	10	1116	1125	20 %	40 %	20 %	20 %	409250981
27	NT_187107	ATT	2	6	1193	1198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250981
28	NT_187107	TATG	2	8	1200	1207	25 %	50 %	25 %	0 %	409250981
29	NT_187107	CGG	2	6	1269	1274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250981
30	NT_187107	AAG	2	6	1465	1470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250981
31	NT_187107	A	6	6	1475	1480	100 %	0 %	0 %	0 %	409250981
32	NT_187107	TCA	2	6	1532	1537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NT_187107	AAC	2	6	1573	1578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250982
34	NT_187107	ATT	2	6	1585	1590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250982
35	NT_187107	AAC	2	6	1639	1644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250982
36	NT_187107	ATA	2	6	1647	1652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250982
37	NT_187107	A	6	6	1659	1664	100 %	0 %	0 %	0 %	409250982
38	NT_187107	TAA	3	9	1731	1739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250982
39	NT_187107	CTG	2	6	1775	1780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250982
40	NT_187107	TAA	2	6	1783	1788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250982
41	NT_187107	TCC	2	6	1808	1813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409250982
42	NT_187107	GAA	2	6	1860	1865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250982
43	NT_187107	A	6	6	1864	1869	100 %	0 %	0 %	0 %	409250982
44	NT_187107	A	7	7	1954	1960	100 %	0 %	0 %	0 %	409250982
45	NT_187107	ATA	2	6	1999	2004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250982
46	NT_187107	AATA	2	8	2010	2017	75 %	25 %	0 %	0 %	409250982
47	NT_187107	GGC	2	6	2023	2028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250982
48	NT_187107	TA	4	8	2052	2059	50 %	50 %	0 %	0 %	409250982
49	NT_187107	CAAAAA	2	12	2115	2126	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	409250982
50	NT_187107	CA	3	6	2152	2157	50 %	0 %	0 %	50 %	409250982
51	NT_187107	TGT	2	6	2221	2226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NT_187107	TGAA	2	8	2231	2238	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NT_187107	A	6	6	2237	2242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NT_187107	ATT	2	6	2267	2272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NT_187107	TAC	2	6	2275	2280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NT_187107	GCC	2	6	2330	2335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250983
57	NT_187107	CAG	2	6	2468	2473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250983
58	NT_187107	AG	3	6	2472	2477	50 %	0 %	50 %	0 %	409250983
59	NT_187107	TGCA	2	8	2667	2674	25 %	25 %	25 %	25 %	409250983
60	NT_187107	CGA	2	6	2737	2742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250983
61	NT_187107	GC	3	6	2758	2763	0 %	0 %	50 %	50 %	409250983
62	NT_187107	CG	3	6	2764	2769	0 %	0 %	50 %	50 %	409250983
63	NT_187107	ACA	2	6	2793	2798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250983
64	NT_187107	ACCGCC	2	12	2804	2815	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	409250983
65	NT_187107	CAT	2	6	2842	2847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250983
66	NT_187107	TGG	2	6	2884	2889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250983
67	NT_187107	CATCG	2	10	2900	2909	20 %	20 %	20 %	40 %	409250983
68	NT_187107	CGC	3	9	2941	2949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250983
69	NT_187107	AGT	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250983
70	NT_187107	AGGC	2	8	3075	3082	25 %	0 %	50 %	25 %	409250983
71	NT_187107	CAC	2	6	3110	3115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250983
72	NT_187107	GCC	3	9	3188	3196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250983
73	NT_187107	CTGC	2	8	3265	3272	0 %	25 %	25 %	50 %	409250983
74	NT_187107	GA	3	6	3403	3408	50 %	0 %	50 %	0 %	409250983
75	NT_187107	CTG	2	6	3452	3457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250983
76	NT_187107	TTA	2	6	3459	3464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250983
77	NT_187107	TTCA	2	8	3507	3514	25 %	50 %	0 %	25 %	409250983
78	NT_187107	CA	3	6	3624	3629	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NT_187107	TGA	2	6	3742	3747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250984
80	NT_187107	GGC	2	6	3800	3805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250984
81	NT_187107	ATT	2	6	3844	3849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250984
82	NT_187107	TCA	2	6	3960	3965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250984
83	NT_187107	CG	3	6	3987	3992	0 %	0 %	50 %	50 %	409250984
84	NT_187107	CTGGCG	2	12	3998	4009	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409250984
85	NT_187107	AGC	2	6	4044	4049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250984
86	NT_187107	GCCGCT	2	12	4063	4074	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	409250984
87	NT_187107	GACC	2	8	4150	4157	25 %	0 %	25 %	50 %	409250984
88	NT_187107	CGG	2	6	4305	4310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250984
89	NT_187107	CGTC	2	8	4315	4322	0 %	25 %	25 %	50 %	409250984
90	NT_187107	AAC	2	6	4404	4409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250984
91	NT_187107	GGC	3	9	4481	4489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250984
92	NT_187107	GC	3	6	4497	4502	0 %	0 %	50 %	50 %	409250984
93	NT_187107	GAC	2	6	4556	4561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250984
94	NT_187107	GCCC	2	8	4564	4571	0 %	0 %	25 %	75 %	409250984
95	NT_187107	GC	3	6	4596	4601	0 %	0 %	50 %	50 %	409250984
96	NT_187107	CGC	2	6	4627	4632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250984
97	NT_187107	ATG	2	6	4680	4685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250984
98	NT_187107	GCG	2	6	4716	4721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250984
99	NT_187107	GGATG	2	10	4733	4742	20 %	20 %	60 %	0 %	409250984
100	NT_187107	CAG	2	6	4751	4756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250984
101	NT_187107	CCG	2	6	4788	4793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250984
102	NT_187107	GAC	2	6	4843	4848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250984
103	NT_187107	GGA	2	6	4856	4861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409250984
104	NT_187107	GGC	2	6	4877	4882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250984
105	NT_187107	CCG	2	6	5022	5027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250984
106	NT_187107	CGT	2	6	5038	5043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250984
107	NT_187107	G	6	6	5108	5113	0 %	0 %	100 %	0 %	409250984
108	NT_187107	GTCA	2	8	5117	5124	25 %	25 %	25 %	25 %	409250984
109	NT_187107	CAC	2	6	5131	5136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250984
110	NT_187107	CT	3	6	5142	5147	0 %	50 %	0 %	50 %	409250984
111	NT_187107	ACG	2	6	5172	5177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250984
112	NT_187107	CGC	2	6	5187	5192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250984
113	NT_187107	CAG	2	6	5207	5212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250984
114	NT_187107	GAA	2	6	5264	5269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250984
115	NT_187107	GCG	2	6	5361	5366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250984
116	NT_187107	TGG	2	6	5397	5402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250984
117	NT_187107	CCACG	2	10	5419	5428	20 %	0 %	20 %	60 %	409250984
118	NT_187107	CGG	2	6	5466	5471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250984
119	NT_187107	CGCCTG	2	12	5472	5483	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	409250984
120	NT_187107	GC	3	6	5508	5513	0 %	0 %	50 %	50 %	409250984
121	NT_187107	GGC	2	6	5560	5565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250984
122	NT_187107	GGC	2	6	5608	5613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250984
123	NT_187107	GTCA	2	8	5675	5682	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NT_187107	GGC	2	6	5692	5697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NT_187107	CG	3	6	5779	5784	0 %	0 %	50 %	50 %	409250985
126	NT_187107	TCA	2	6	5859	5864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250985
127	NT_187107	TCG	2	6	5931	5936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250985
128	NT_187107	ATC	2	6	5994	5999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250985
129	NT_187107	TTAA	2	8	6031	6038	50 %	50 %	0 %	0 %	409250986
130	NT_187107	TGA	2	6	6105	6110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250986
131	NT_187107	CGC	2	6	6244	6249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250986
132	NT_187107	AAC	2	6	6257	6262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250986
133	NT_187107	GCGTC	2	10	6317	6326	0 %	20 %	40 %	40 %	409250986
134	NT_187107	GC	3	6	6367	6372	0 %	0 %	50 %	50 %	409250986
135	NT_187107	GC	3	6	6408	6413	0 %	0 %	50 %	50 %	409250986
136	NT_187107	GGT	2	6	6444	6449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250986
137	NT_187107	CAG	2	6	6465	6470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250986
138	NT_187107	AGAT	2	8	6473	6480	50 %	25 %	25 %	0 %	409250986
139	NT_187107	TCG	3	9	6485	6493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250986
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242	NT_187107	CAGC	2	8	11034	11041	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
243	NT_187107	AAGCG	2	10	11059	11068	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
244	NT_187107	GCA	2	6	11076	11081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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252	NT_187107	T	6	6	11688	11693	0 %	100 %	0 %	0 %	409250993
253	NT_187107	ATT	3	9	11725	11733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
254	NT_187107	AGG	2	6	11743	11748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
255	NT_187107	CCA	2	6	11902	11907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250994
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257	NT_187107	CG	4	8	11998	12005	0 %	0 %	50 %	50 %	409250994
258	NT_187107	TCG	2	6	12021	12026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250994
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261	NT_187107	T	6	6	12143	12148	0 %	100 %	0 %	0 %	409250994
262	NT_187107	T	6	6	12192	12197	0 %	100 %	0 %	0 %	409250994
263	NT_187107	ACA	2	6	12231	12236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250994
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268	NT_187107	TCAG	2	8	12393	12400	25 %	25 %	25 %	25 %	409250994
269	NT_187107	AT	3	6	12420	12425	50 %	50 %	0 %	0 %	409250994
270	NT_187107	GAC	2	6	12467	12472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250994
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272	NT_187107	T	6	6	12568	12573	0 %	100 %	0 %	0 %	409250994
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400	NT_187107	ATT	2	6	19136	19141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250999
401	NT_187107	TGA	2	6	19143	19148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250999
402	NT_187107	ACC	2	6	19172	19177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250999
403	NT_187107	GTC	2	6	19184	19189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250999
404	NT_187107	GCG	2	6	19287	19292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250999
405	NT_187107	TGA	2	6	19311	19316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250999
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439	NT_187107	GATT	2	8	21125	21132	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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441	NT_187107	CTGG	2	8	21232	21239	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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499	NT_187107	GTA	2	6	23617	23622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
500	NT_187107	CCA	2	6	23665	23670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251002

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